Sau đó, khi có văn bản yêu cầu phản biện cụ thể và nhận được hồ sơ dự án cần phản biện của Sở GTVT giao ( thông qua Liên hiệp Hội TP ), Chủ tịch Hội CĐC đã ra Quyết định thành lập Hội đồng phản biện của từng dự án, thường bao gồm 07 thành viên trở lên do một chuyên gia đầu ngành làm Chủ tịch hội đồng để tiến hành công tác phản biện. Cụ thể như Dự án phản biện Cầu Sài Gòn 2 được giao cho Chi hội CĐC XN Tư vấn Cầu đường TEDI South phụ trách, do GS.TS Hoàng Công Luận – Chủ tịch HĐ.

-Dự án phản biện Cầu Phú Xuân IIB giao cho Chi hội CĐC Trung tâm KH&CN Cầu đường cảng phụ trách, do KSCC Phạm Văn Chấn làm Chủ tịch Hội đồng.

- Dự án phản biện Đường trên cao số II giao cho Chi hội CĐC Trung tâm Nghiên cứu phát triển GTVT- Bộ GTVT phụ trách và do TS Trần Xuân Dũng – Chủ tịch HĐ.

 - Dự án Cải tạo và nâng cấp Đường Đặng Thúc Vịnh ( Tỉnh lộ 9 - Hóc Môn ) giao cho Chi hội Khu đường bộ 7 do KSCC Phạm Thúc Hân – Chủ tịch Hội đồng.

 Về kinh phí phản biện, đến nay đã hoàn thành thủ tục thanh toán gửi lên Liên Hiệp hội được 02 dự án  ( Cầu Phú Xuân II và Đường Đặng Thúc Vịnh )

 Do khối lượng dự án được Thành phố giao khá nhiều nên Hội đồng KH&CN của Hội đã động viên lực lượng trí thức của hầu hết các chi hội thành viên để tiến hành công tác phản biện  ( tính đến tháng 6/2009, Hội CĐC đã có 27 chi hội thành viên bao gồm 487 hội viên hoạt động trong  các đơn vị tư vấn, các Viện nghiên cứu, các Khu quản lý GT đô thị, các Ban quản lý dự án của Bộ GTVT và của các Quận Huyện, các Tổng công ty thi công trực thuộc Bộ đóng tại thành phố và các chi hội Cầu đường cảng của 4 trường Đại học: Bách Khoa, ĐH Kỹ thuật – công nghệ TPHCM, ĐH Giao thông vận tải.cơ sở 2 và Đại học Giao thông vận tải TP Hồ Chí Minh).

Ngay từ đầu nhiệm kỳ 2, BCH Hội CĐC đã đặt nhiệm vụ TVPB&GĐXH là trọng tâm công tác của Hội, và trong thời gian qua, tiếng nói của Hội CĐC đã được các cấp lãnh đạo và LHH Thành phố chú ý, động viên tạo điều kiện giúp đỡ. Việc giao cho Hội CĐC 26 dự án phản biên trên đã nói lên sự quan tâm đó. Tuy nhiên, đến nay các thủ tục và nội dung trình tự hoàn thành hồ sơ phản biện và thanh toán còn rườm rà, thời gian làm thủ tục kéo dài. Đề nghị lãnh đạo LHHTP và các phòng, ban chức năng của LHH nghiên cứu cải tiến trình tự thủ tục để đẩy nhanh tiến độ phản biện các dự án Giao thông hơn nữa 

HOẠT ĐỘNG TỔ CHỨC HỘI THẢO, BÁO CÁO CHUYÊN ĐỀ VÀ THAM QUAN CÁC CÔNG TRÌNH GIAO THÔNG TRỌNG ĐIỂM THÀNH PHỐ VÀ CÁC TỈNH PHÍA NAM

Trong 06 tháng qua Hội đã tổ chức được ba hội thảo chuyên đề:
- Hội thảo về: "Ứng dụng Công nghệ mới Lưới địa kỹ thuật TENSAR để gia cố nền đường trong đô thị và vùng đất yếu".
- Hội thảo và báo cáo chuyên đề về: " Công nghệ kỹ thuật tạo nhám siêu mỏng Novachip, ứng dụng trên hệ thống cầu đường cao tốc của Việt Nam"
- Hội thảo và báo cáo chuyên đề về: "Công nghệ Polymeric trong xây dựng tường chắn đất có cốt ứng dụng ở các công trình cầu đường Thành phố và các tỉnh phía Nam."

Các cuộc hội thảo đã thu hút được đông đảo hội viên tham gia và thảo luận sôi nổi, bình quân mỗi cuộc hội thảo có trên 150 hôi viên tham gia, có tác dụng gắn kết và động viên hội viên tăng cường sinh hoạt Hội.